| Titre : | Analyse de la diversité génétique et étude des associations pour des traits de fruits et de feuilles chez l’olivier (Olea europaea L.) |
| Auteurs : | AZOUR Imane, Auteur ; BELQADI Loubna, Auteur ; EL BAKKALI Ahmed, Auteur |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Rabat : IAV Hassan II, 2024 |
| Format : | 117 |
| Langues: | Français |
| Mots-clés: | Olea europaea L. ; diversité génétique ; diversité phénotypique ; GWAS ; SNP ; héritabilité ; déséquilibre de liaison. |
| Résumé : |
L'analyse de la diversité phénotypique et génétique des collections de germoplasme représente
une étape importante dans le processus d'amélioration des espèces pérennes, comme l'olivier (Olea europaea L.), afin de faire face aux enjeux et aux contraintes engendrés par les changements climatiques. Cette étude vise à exploiter les données sur la diversité phénotypique et génétique contenue dans la collection mondiale de l’olivier de l’INRA de Marrakech, en vue d'évaluer le niveau de diversité phénotypique des traits liés aux fruits (quatre traits) et aux feuilles (huit traits), d'analyser la diversité génétique et sa structuration, et d’initier des études d'association pangénomiques (GWAS) pour identifier d’éventuelles associations phénotype-génotype pour certains traits ciblés. Les résultats ont révélé une variabilité phénotypique significative, avec des valeurs d’héritabilité (H2) allant de modérées (0,20) à élevées (0,77) pour la plupart des traits évalués. L'analyse de variance a montré des variations annuelles significatives pour tous les traits foliaires (surface foliaire, largeur et longueur de la feuille), ainsi que pour le poids de l'endocarpe et le rapport pulpe/endocarpe des fruits. L'origine géographique des variétés a également montré un effet significatif, les variétés originaires de l'Est de la Méditerranée présentant généralement des fruits plus gros. L'analyse génétique utilisant 195.049 SNPs générés par l’approche de séquençage par capture de gènes sur 318 variétés a mis en évidence une structuration génétique en trois pools distincts, correspondant aux régions 0uest, Centre et Est de la Méditerranée, reflétant ainsi l'histoire évolutive complexe de l'espèce. Le déséquilibre de liaison a montré une décroissance rapide (541 bases), caractéristique des espèces allogames et auto-incompatibles comme l'olivier. L’analyse GWAS, utilisant le modèle rrBLUP, a identifié 20 associations entre des marqueurs SNP et divers traits des fruits et des feuilles, fournissant des pistes prometteuses pour la compréhension des mécanismes d'adaptation à la sécheresse et les gènes impliqués dans l’expression des traits d’intérêt agronomique. Cette étude constitue un point de départ prometteur pour la conduite des programmes d’amélioration génétique visant à répondre aux défis posés par le changement climatique. Elle ouvre la voie à une nouvelle ère de sélection génomique basée sur les avancées technologiques dans l’acquisition des données génomiques et le traitement rapide de l’information. Ceci permettrait dans un proche avenir, d’identifier et de sélectionner de nouvelles variétés adaptées aux conditions environnementales actuelles et futures à des stades précoces et à moindre coût. Des études complémentaires sont jugées nécessaires afin de valider nos résultats de GWAS, d’établir des modèles de prédiction phénotype-génotype et d’identifier des gènes candidats associés aux SNPs déclarés significatifs. |
| En ligne : | http://10.2.0.27/PDF_CDA/uploads/PDF/AZOUR_Imane_2024.pdf |
Exemplaires (1)
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
|---|---|---|---|---|---|
| 200041392 | 10361 | Support papier | Salle des thèses/PFE (RDC) | Ingénieur Agronome | Consultation sur place Exclu du prêt |
