Titre : | Etude du profil de résistance aux antibiotiques d’Enterococcus et d’Entérobactéries isolés des eaux continentales et marines au Maroc |
Auteurs : | SADIQ Farah, Auteur ; KADIRI Ahlam, Auteur |
Type de document : | texte imprimé |
Editeur : | Rabat : IAV Hassan II, 2023 |
Format : | 110 |
Langues: | Français |
Mots-clés: | Enterobacteriacea ; E. coli ; Enterococcus ; Salmonella ; Environnement ; Antibiorésistance ; Antibiotique ; Antibiogramme ; CMI ; Maldi- Tof ; One Health ; Multirésistance. |
Résumé : |
L'antibiorésistance est l'une des plus grandes menaces pour la santé humaine, animale et l'écosystème mondial. Ce phénomène est très complexe, son évolution dépend du contact bactérie-antibiotique mais également du transfert des gènes de résistance entre bactéries et la transmission des bactéries résistantes entre espèces hôtes et l’environnement. L’environnement aquatique reçoit non seulement les rejets et les traces d’antibiotiques mais également une multitude d’espèces bactériennes, ce qui en fait l’un des principaux réservoirs de gènes de résistance. Notre étude, étant la première à s’intéresser à ce phénomène dans l’environnement au Maroc, s’est concentrée sur les bactéries E. coli et Enterococcus, comme espèces indicatrices de l’évolution de l’antibiorésistance, en raison de leur prédominance dans les milieux aquatiques.
Les objectifs fixés pour cette étude sont les suivants : - Etude bactériologique des eaux continentales (oueds, lacs, eaux souterraines, eaux non potables d’arrosage) - Evaluation de la sensibilité aux antibiotiques de Enterococcus et des Enterobacteriacea principalement E. coli, isolés à partir de l’environnement aquatique aussi bien continental que marin. Le protocole de travail que nous avons suivi comprend plusieurs étapes. Tout d'abord, nous avons effectué des prélèvements qui ont concerné 7 oueds, 2 lacs, 4 sources d'eau souterraines et 4 sources d'eau non potables d'arrosage. Nous avons également utilisé 50 plaques de kits de détection rapide des bactéries E. coli et Enterococcus dans les eaux de plages : kits Colilert-18 et trousses Enterolet-E. L'étape suivante consistait à identifier les bactéries isolées à partir de ces prélèvements, commençant par une différenciation visuelle des colonies sur différents milieux, passant par l'observation microscopique, les tests biochimiques classiques, et même des techniques avancées comme la spectrométrie de masse de type Maldi-Tof. Nous avons, enfin, étudié la sensibilité des bactéries aux différents antibiotiques à l'aide d'antibiogrammes et de la CMI. L'étude bactériologique des eaux continentales a révélé la présence d'une diversité d'espèces bactériennes, dont E. coli était la plus abondante. En effet, sur les 17 prélèvements effectués, E. coli a été trouvée dans 6 d'entre eux, notamment dans les eaux des oueds. Rahnella aquatilis a été détectée dans 3 prélèvements, tandis que Salmonella sp. a été identifiée dans les eaux de Sidi Boughaba. Klebsiella pneumonia a été isolée à partir d’une eau d'arrosage à Madinat al Irfane. Par ailleurs, Enterococcus n'a été retrouvé que dans un seul prélèvement, provenant de l'eau d'arrosage de la corniche de Rabat. Trois prélèvements n'ont présenté aucune trace de bactérie pathogène, à savoir l’eau d’un puit à Témara, l’eau d’arrosage d’un espace vert à Rabat et l’eau de l’oued Boufekrane. Lors de la phase d'étude axée sur les kits d’analyse Colilert-18 et trousses d’analyse Enterolet-E, nous avons obtenu des résultats partiels. Nous n’avons pu isoler E. coli qu’à partir de 19 plaques sur les 26 plaques positives examinées et Enterococcus à partir de 17 plaques sur 24. L’identification par spectrométrie de masse des isolats d’Enterococcus a révélé une prédominance marquée de l’espèce E. faecalis dans les échantillons examinés avec un taux de 78%. E. faecium était présente dans le reste des échantillons. Aucune autre espèce n’a été détectée. L’étude de sensibilité des Enterobacteriacea continentales, autres que E. coli, a révélé les résultats suivants : 100% des souches étaient sensibles à la Sulfamethoxazole -trimethoprime, tandis que le taux de sensibilité à la fluméquine était de 90.9%. En revanche, 90.9% des souches se sont avérées résistantes à l'amoxicilline et à l'association amoxicilline-acide clavulanique. Pour E. coli (souches continentales et pélagiques confondues), les résultats étaient les suivants : 100% des souches étudiées se sont révélées sensibles à la céfotaxime. De plus, 80% ont été sensibles à la tigécycline et 84% des souches ont montré une sensibilité à la colistine. En revanche, les taux de sensibilité les plus faibles ont été observés pour l'association amoxicilline-acide clavulanique, avec seulement 24% des souches sensibles, et pour l'amoxicilline, avec aucune souche sensible (0%). La production de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) a été observée chez 20% des E. coli étudiées. Dans le cas des souches d'Enterococcus étudiées, les résultats sont les suivants : 100% des souches se sont révélées sensibles à la vancomycine. Les pourcentages de sensibilité au linézolide et à la norfloxacine étaient successivement de 89% et 78%. Cependant, 56% des souches étaient sensibles à forte exposition à l'érythromycine et 50% étaient résistantes à l’Ampicilline. Par ailleurs, 100% des souches ont exprimé une résistance naturelle de bas niveau à la Gentamicine, tandis que 72% des souches ont exprimé une résistance acquise de haut niveau à la streptomycine. |
En ligne : | http://10.2.0.27//cda/ebooks/SADIQ_Farah_2023.pdf.pdf |
Exemplaires (1)
Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
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200041111 | 10170 | Support papier | Salle des thèses/PFE (RDC) | Docteur vétérinaire | Libre accès Disponible |